游戲背景設定在第二次末日之戰戰爭,玩家需要指揮帝國的鋼鐵軍團和太空陸戰隊來對抗Ghazghkull Thraka的獸人軍隊的入侵。戰錘40k:末日之戰擁有超過35個任務關卡,超過100種單位類型,每一種都有獨特的定位、戰錘40k:末日之戰屬性和特殊能力,總共有20項不同的單位屬性。